癸亥日，出现了日食。刘秀下诏让百官上书进言，并且规定上书时不能称他为“圣”。太中大夫郑兴上书说：“国家要是政治不清明，就会在日月运行上出现异象。关键在于顺应民心，选贤任能。现在公卿大夫们大多举荐渔阳太守郭汲，认为他可以胜任大司空一职，可朝廷却不及时决定。外面流言纷纷，都说‘朝廷想用功臣担任大司空’，如果真的任用功臣，那官员的任用就乱了套。希望陛下能委屈自己，听从大家的意见，成全群臣推举贤才的美意。近年来，日食大多发生在月末，而且月亮总是提前和太阳重合，这说明月亮运行速度太快。太阳象征君主，月亮象征臣子，君主过于严厉急躁，臣子就会感到紧迫，所以月亮运行速度才会加快。如今陛下处理政事英明果决，但群臣却感到惶恐不安，希望陛下能多考虑用温和的方式治理国家，重视《洪范》中记载的治国方法。”刘秀一直亲自处理政事，有时过于严厉急躁，所以郑兴才会在奏疏中提到这些。
建武七年（公元31年）
四月壬午日，刘秀宣布大赦天下。
五月戊戌日，他任命之前的将军李通担任大司空。
当时，大司农江冯向刘秀提议：“应该让司隶校尉监督检查三公。”司空的属官陈元却不同意，上书劝阻说：“我听说，把臣子当作老师的君主能成就帝业，把臣子当作宾客的君主能成就霸业。周武王把姜太公尊为老师，齐桓公称管仲为仲父，汉高祖对相国礼遇有加，汉文帝给予宰辅大权。但到了王莽篡汉，他趁着汉朝衰落，独揽大权，还总觉得自己了不起，不信任大臣，夺走三公的权力，削弱宰相的威严，鼓励大家互相揭发，甚至出现仆人告发主人、子弟检举父兄的情况。他制定的法律又严苛又细密，大臣们做事都畏手畏脚。即便如此，他还是没能阻止董忠的谋反，最后自己也落得被杀的下场。现在天下还不太平，百姓都在看着朝廷的一举一动。陛下应该学习周文王、周武王的治国之道，继承祖宗的美德，礼贤下士，不应该让有关部门去监察三公。”刘秀觉得陈元说得在理，就采纳了他的建议。
酒泉太守竺曾的弟弟为报仇杀了人，竺曾为了这事，主动辞去了太守的职务。窦融按照刘秀的旨意，任命竺曾为武锋将军，同时让辛肜接替他做酒泉太守。
到了秋天，隗嚣带着三万步兵和骑兵侵犯安定，一路打到阴盘。冯异率领众将领抵抗，隗嚣又派其他将领从陇山下来，在汧县攻打祭遵。但隗嚣这次没占到便宜，只能无功而返。刘秀原本打算亲自去征讨隗嚣，还提前和窦融约定了出兵时间，结果遇上大雨，道路被冲断，加上隗嚣的军队已经撤退，只好作罢。后来，刘秀让来歙写信劝降王遵，王遵就来投降了。刘秀封他做太中大夫，还赐给他向义侯的爵位。
冬天的时候，卢芳因为一些事情杀了五原太守李兴兄弟。朔方太守田飒、云中太守乔扈见状，各自带着自己管辖的郡向刘秀投降，刘秀让他们继续担任原来的官职。
刘秀特别相信图谶。有一次，他和郑兴讨论郊祀的事情，说：“我想用图谶来做决定，你觉得咋样？”郑兴回答：“我不信图谶。”刘秀一听就火了，说：“你不信图谶，是反对它吗？”郑兴吓得赶紧解释：“我只是对图谶没什么研究，并不是反对它。”刘秀这才消了气。
本小章还未完，请点击下一页继续阅读后面精彩内容！
南阳太守杜诗把南阳治理得很好，为百姓兴修水利、发展生产、铲除祸害，老百姓日子过得很舒坦。他还带领大家整修池塘，开垦农田，家家户户都富裕起来。人们把他和以前的好官召信臣相提并论，说“前有召父，后有杜母”，把他们当作父母一样敬重。
建武八年（公元32年）
春天，来歙带着两千多人翻山开路，从番须、回中抄小路，突然袭击略阳，杀掉了隗嚣的守将金梁。隗嚣得知消息，大吃一惊：“这也太神出鬼没了！”刘秀听说拿下了略阳，高兴坏了，说：“略阳是隗嚣倚仗的重要据点，心腹被端了，收拾他的其他地方就容易多了！”吴汉等将领听说来歙占据了略阳，都争着要去支援。但刘秀觉得，隗嚣丢了这么重要的地方，肯定会调集精锐部队来攻打。如果让隗嚣长时间围城却攻不下来，等他的士兵疲惫不堪时，再趁机进攻更好。于是，刘秀把吴汉等人都追了回来。隗嚣果然派王元在陇坻防守，行巡把守番须口，王孟堵住鸡头道，牛邯在瓦亭驻军。隗嚣自己则带着几万人包围了略阳，公孙述也派李育、田弇来帮忙。他们砍树筑堤，用水灌城。来歙和将士们拼死坚守，箭用完了，就拆房子、砍木头当武器。隗嚣使出全力攻打，好几个月都没打下来。
闰四月，刘秀决定亲自出征讨伐隗嚣。光禄勋郭宪劝他：“东方刚平定，陛下不宜远行。”甚至拔出佩刀砍断了刘秀马车的缰绳，但刘秀没听劝，率军西行到了漆县。将领们大多觉得，朝廷大军不该冒险深入险要之地，大家犹豫不决。刘秀就把马援找来商量。马援分析说，隗嚣的将帅已经人心涣散，我们出兵一定能打败他。他还在刘秀面前用米堆成山谷模型，讲解地形和进军路线，分析得明明白白。刘秀听了，信心大增：“敌人的情况我清楚了！”第二天一早，大军就继续前进，到达高平第一城。窦融率领五郡太守，还有羌人、小月氏等几万人的军队，带着五千多辆装满物资的车子，和刘秀的大军会合。当时军队刚组建，将领们朝见时礼仪不太规范，窦融就先派属官去询问朝见的礼仪。刘秀知道后，觉得窦融做事周到，还把这事告诉了百官。接着，刘秀大摆宴席，用特别隆重的礼节招待窦融等人。随后，大军兵分几路向陇山进发。刘秀让王遵写信劝降牛邯，牛邯投降后，被封为太中大夫。这下，隗嚣的十三个大将、十六个属县、十多万士兵都投降了。隗嚣带着妻子儿女逃到西城，投奔杨广，田弇、李育则据守上邽，略阳的包围也解除了。刘秀犒劳赏赐来歙，让他坐在最尊贵的席位上，还赐给他妻子千匹细绢。刘秀又前往上邽，下诏给隗嚣：“你要是投降，还能父子相见，保你没事。要是非要像黥布那样顽固，那就别怪我不客气。”但隗嚣始终不肯投降，刘秀只好杀了他的儿子隗恂。刘秀派吴汉、岑彭包围西城，耿弇、盖延包围上邽。为了表彰窦融，刘秀把四个县封给他，封他为安丰侯，封窦融的弟弟窦友为显亲侯，五郡太守也都封侯，然后让他们回到原来镇守的地方。窦融因为长时间掌管一方，心里不安，多次上书请求派人接替自己。刘秀回复说：“我和你就像左右手，别总推辞，好好安抚百姓，别擅自离开军队！”这时，颍川盗贼四起，很多县城被攻占，河东的守兵也叛变了，京城一片混乱。刘秀后悔地说：“我真该听郭宪的话。”
八月，刘秀从上邽日夜往东赶，给岑彭等人写信说：“要是西城、上邽这两座城攻下来，你们就带兵南下攻打公孙述。人总是不知足，我刚平定陇地，又想着平定蜀地。每次出兵，头发都愁白了！”
九月乙卯日，刘秀回到皇宫。他对执金吾寇恂说：“颍川离京城太近，得赶紧平定。想来想去，只有你能搞定，辛苦你再出山一趟吧！”寇恂说：“颍川的盗贼听说陛下在陇、蜀用兵，才趁机作乱。要是他们知道陛下亲自南征，肯定吓得投降。我愿意当先锋！”刘秀同意了。庚申日，刘秀率军南征，颍川的盗贼果然纷纷投降。寇恂还没正式任职，百姓就拦路请求：“希望陛下能把寇大人再留给我们一年。”于是刘秀把寇恂留在长社，让他安抚百姓，接收剩余的降兵。东郡、济阴也出现了盗贼，刘秀派李通、王常去攻打。因为东光侯耿纯以前在东郡做太守，很有威信，刘秀就派他为太中大夫，让他和大军在东郡会合。东郡的盗贼听说耿纯来了，九千多人都向他投降，大军不战而回。刘秀又下诏书让耿纯重新担任东郡太守。戊寅日，刘秀从颍川回到洛阳。
安丘侯张步带着妻子儿女逃到临淮，想和弟弟张弘、张蓝召集旧部，乘船出海。琅邪太守陈俊追击，把他们都杀了。
十月丙午日，刘秀前往怀县。
十一月乙丑日，回到洛阳。
杨广死了，隗嚣陷入绝境。他的大将王捷守在戎丘城，登上城墙对汉军喊：“为隗王守城的人，都不怕死，绝不投降！希望你们赶快退兵，我自杀来表明决心！”说完就自刎了。
本小章还未完，请点击下一页继续阅读后面精彩内容！
之前，刘秀曾告诫吴汉：“各郡征来的士兵只会浪费粮食，要是有人逃跑，还会动摇军心，都遣散了吧。”但吴汉等人想集中兵力快点打败隗嚣，就没听刘秀的话。结果粮食越来越少，士兵们又累又饿，逃跑的人越来越多。岑彭用水灌西城，水位离城墙顶只剩一丈多。就在这时，王元、行巡、周宗带着五千多公孙述的救兵，突然从高处杀到，大喊：“百万大军到了！”汉军毫无防备，乱了阵脚，还没摆好阵势，王元等人就拼命突围，冲进西城，带着隗嚣逃回冀县。吴汉的军队没了粮食，只好烧毁辎重，从陇山撤退，盖延、耿弇也跟着后撤。隗嚣出兵追击，岑彭断后，众将才得以全军东归，只有祭遵坚守在汧县没有后退。吴汉等人撤回长安屯守，岑彭回到津乡。这样一来，安定、北地、天水、陇西又被隗嚣占据。校尉温序是太原人，被隗嚣的将领苟宇俘虏。苟宇多次劝他投降，温序大怒：“你们这些反贼，竟敢逼迫汉朝将领！”一边骂，一边用手中的符节打死了好几个人。苟宇的部下要杀他，苟宇拦住说：“这是位义士，让他以义士之礼自尽吧。”温序接过剑，把胡须叼在嘴里，说：“我既然被贼人杀，不能让胡须沾泥土！”说完就拔剑自杀了。他的下属王忠带着他的灵柩回到洛阳，刘秀下诏赐给他墓地，还封他的三个儿子为郎官。
十二月，高句丽国王派使者来到东汉朝廷进贡，刘秀恢复了他的王号，双方保持了友好的往来关系。这一年，国内发生了大水灾，给百姓生活和农业生产带来了严重影响 。
建武九年（公元33年）
春天，正月，颍阳成侯祭遵在军中去世。祭遵为人廉洁节俭、做事谨慎，总是严格要求自己，一心为国家效力。他把得到的赏赐全部分给士兵，军队纪律严明，所到之处，当地百姓甚至感觉不到军队的存在。他选拔人才注重儒家学问，军中摆酒作乐时，也常演奏雅乐、玩投壶游戏。临终前，他叮嘱家人丧事从简，当别人问起他的家事，他始终闭口不谈。祭遵的离世让刘秀十分悲痛。祭遵的灵柩运到河南时，刘秀身穿素服亲自前去吊唁，望着灵柩痛哭；回宫途中，刘秀又停在城门口，看着运送祭遵灵柩的车队经过，泪水止不住地流；丧礼结束后，刘秀又用太牢之礼亲自祭祀他。刘秀还下诏让大长秋、谒者、河南尹负责操办丧事，大司农提供治丧费用。下葬时，刘秀再次亲临；下葬后，刘秀又来到他的坟前，慰问祭遵的夫人和家人。此后每次朝会，刘秀都会感叹：“上哪再去找像祭征虏（祭遵）这样忧国奉公的人啊！”卫尉铫期说：“陛下太过仁爱，一直悼念祭遵，让我们这些大臣既感动又惭愧惶恐。”刘秀这才不再常常提及。
隗嚣又病又饿，只能吃些粗糙干粮，最终愤恨而死。王元、周宗拥立隗嚣的小儿子隗纯为王，继续带兵坚守冀县。公孙述派将领赵匡、田弇前来协助隗纯。刘秀则派冯异前去攻打。